Comprender los efectos de la mutación sobre la afinidad de unión a proteínas es importante para su desarrollo, especialmente en el área de la terapia de proteínas. Las predicciones in silico de los efectos de la mutación pueden ayudar a guiar el experimento y reducir el costo de llevar la terapia al mercado. Las proteínas modificadas pueden optimizar, por ejemplo, el comportamiento de la unión a proteínas dependiendo del pH de la solución. Para esto, se necesitan métodos teóricos que puedan predecir las energías de mutación en diferentes soluciones de pH.

A diferencia de la mayoría de los métodos disponibles, la mutagénesis de escaneo virtual de BIOVIA Discovery Studio permite escanear el estudio de la dependencia del pH de la ionización de proteínas. Los investigadores pudieron, a través del software, proponer una estrategia computacional para buscar mutaciones que pudieran alterar el comportamiento de unión a FcRn dependiente del pH de IgG, con el fin de mejorar la vida media de los anticuerpos terapéuticos en el organismo objetivo. No solo para Protein Engineering, el método implementado en BIOVIA Discovery Studio se puede utilizar para estudiar mutaciones en la unión de ligandos, interacciones proteína-ADN o en la creación de inhibidores de proteínas selectivas de pH o enzimas para fines biotecnológicos.