A pandemia causada por Coronavirus se acerca a 900.000 muertes y 27,5 millones de infectados en todo el mundo, según el informe de la Universidad Johns Hopkins. La mortalidad de la enfermedad está ligada a la que tiene facilidad la proteína Sars-CoV-2 para atacar las células humanas mediante la unión de receptores ace2 (enzima convertidora de angiotensina-2) presentes en los alveolos pulmonares.

Este conjunto de proteínas de forma puntiaguda (Figura 1) ubicadas en la superficie del virus, forman una especie de corona (de ahí el nombre corona) y promueve su acceso, causando síndrome respiratorio grave en varias personas. En medio de la emergencia mundial, investigadores de todo el mundo están buscando fármacos que controlan la enfermedad, y la simulación molecular ha sido uno de sus aliados clave para los expertos en el tema.

«El modelado molecular es fundamental para optimizar el desarrollo de un fármaco, dada la necesidad de estudiar sistemas con un gran número de átomos y diversos compuestos droga-candidatos.»

Carlos Rangel, profesor del curso de Farmacia celebrada en la UFRJ (Brasil).

Además, para el especialista, una de las ventajas de la metodología es la rápida obtención de información correlacionada con la estructura 3D, definido por parámetros de actividad del microorganismo. Recientemente, IBM encontró 77 posibles fármacos contra Sars-CoV-2 de una base de datos de 8.000 sustancias diferentes utilizando simulación molecular. A pesar del progreso en los resultados, la metodología es todavía poco conocida entre los investigadores debido a la necesidad de un especialista en programación para manejar algoritmos en código abierto.

VDada la barrera curricular en el desarrollo de fármacos y la alta demanda de soluciones frente al caos público, BIOVIA Discovery Studio surge como la mejor opción para que los especialistas, que no tienen experiencia en programación, estudien posibles fármacos contra el coronavirus.

El software desarrollado por Dassault Systemes y comercializado en Brasil por EDC Tecnologia es una plataforma completa de métodos de simulación molecular que reúnen más de 30 años de investigación confrontada con datos experimentales. La plataforma proporciona a los investigadores un conjunto de herramientas para el acoplamiento molecular, homología, ADME, predicción de toxicidad, simulaciones clásicas y más. Con sus potentes métodos de cribado, BIOVIA Discovery Studio puede aprovechar  la investigación optimizando la elección de los candidatos.

Los invitamos a dar un vistazo al siguiente video, donde se podrá observar con detalle cómo BIOVIA Discovery Studio puede ayudar a los investigadores a explorar las interacciones moleculares y desarrollar nuevos fármacos:

https://youtu.be/LZArERvfmK4

Referencias:

• CENTER FOR SYSTEMS SCIENCE AND ENGINEERING (CSSE). Johns Hopkins University, 2020. Disponível em: https://coronavirus.jhu.edu/map.html.
• GREEN, Adam. BIOVA Blog, 2020. Disponible en: https://blogs.3ds.com/biovia/structural-modeling-and-refinement-of-the-sars-cov-2-s-protein/. Acesso em 09 de maio de 2020.
• POR que o novo coronavírus consegue se propagar com tanta eficiência. BBC, 2020. Disponible en: https://www.bbc.com/portuguese/internacional-52110672. Acesso em 09 de maio de 2020.
• CINTRA el al. A elaboração de Fármacos a partir de uma perspectiva computacional. Em Foco, 2020. Disponible en: https://noticias.paginas.ufsc.br/files/2020/05/Qcomp-22020.pdf. Acesso em 09 de maio de 2020.
  

   

Bianca Domingues

Especialista en simulaciones numéricas y moleculares en EDC Tecnologia
bianca.domingues@edctecnologia.co